Les Secrétariats exécutifs sont dirigés par des Secrétaires exécutifs nommés dans les mêmes conditions que les Directeurs départementaux.
Ils ont en charge au plan local, la gestion des sites inscrits sur les listes du Patrimoine Culturel National et du Patrimoine Mondial.
A ce jour, un seul Secrétariat a été créee. Il s’agit de celui de la Ville Historique de Grand-Bassam.